Mit dem CUE Splitter kann man eine große Audiodatei, beispielsweise von einer CD, in die einzelnen Tracks aufteilen. Dazu muss jedoch eine passende CUE Datei vorhanden sein. Diese enthält alle nötigen Informationen, die das Tool benötigt, um die einzelnen Tracks zu extrahieren. Die Qualität der Audiodatei wird dabei nicht verändert. Solche CUE Dateien sind oftmals bei großen Sounddateien inkludiert, die z.B. eine komplette CD im MP3-Format enthalten.